同時對主體建筑結構進行了改革：地宮由傳統(tǒng)的九券四門改為四券二門, 地宮內增設龍須溝；隆恩殿的屋頂由重檐歇山頂、面闊5間改為單檐歇山頂，面闊3間，帶回廊。殿外不設石欄。月臺上裁撤了銅鶴、銅鹿，增設了石幢和石日晷；東西配殿由傳統(tǒng)的面闊5間改為面闊3間；陵寢門由三座門改為三間四柱石牌坊；隆恩門前馬槽溝上的三座三孔拱券橋改為一座三孔拱券橋，兩側各加一座五孔平橋。慕陵的建造對后世陵寢產生了較大影響，此后的帝陵都不再建圣德神功碑樓、二柱門。