奇臺荒漠草原保護區(qū)位于新疆昌吉回族自治州奇臺縣境內(nèi)東北部,為第三紀(jì)由山地徑流攜來的洪積物和沖積物所堆積覆蓋,其上多受現(xiàn)在水流,尤其是風(fēng)的加工所刻蝕搬運和堆積,形成面積廣闊的沙丘和沙壟,其南綠是一帶鹽化的沖積平原,平坦而開闊;北緣受阿勒泰山回春的影響略有上升,為第三紀(jì)沉積地層的丘陵臺地。